Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl39lQ9CQD0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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