Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC4

Tmem216, Transmembrane protein 216, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem216Q9CQC4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem216Q9CQC4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem216Q9CQC4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms