Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itgb3bpQ9CQ82 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms