Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hps4Q99KG7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hps4Q99KG7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hps4Q99KG7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms