Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dok4Q99KE3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dok4Q99KE3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dok4Q99KE3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms