Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufsp2Q99K23 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms