Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spef1Q99JL1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spef1Q99JL1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms