Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrna2Q91X60 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chrna2Q91X60 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna2Q91X60 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna2Q91X60 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna2Q91X60 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chrna2Q91X60 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrna2Q91X60 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrna2Q91X60 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms