Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmco4Q91WU4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmco4Q91WU4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms