Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Itm2cQ91VK4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itm2cQ91VK4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itm2cQ91VK4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms