Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE0

Rpe, Ribulose-phosphate 3-epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpeQ8VEE0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RpeQ8VEE0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpeQ8VEE0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms