Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fyco1Q8VDC1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fyco1Q8VDC1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Fyco1Q8VDC1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Fyco1Q8VDC1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms