Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RfxapQ8VCG9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RfxapQ8VCG9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms