Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc9Q8VC31 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms