Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2f4Q8R0K9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2f4Q8R0K9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E2f4Q8R0K9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms