Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ago4Q8CJF8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ago4Q8CJF8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms