Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Znf628Q8CJ78 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Znf628Q8CJ78 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Znf628Q8CJ78 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Znf628Q8CJ78 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf628Q8CJ78 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Znf628Q8CJ78 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Znf628Q8CJ78 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Znf628Q8CJ78 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf628Q8CJ78 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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