Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHY6

Gatad2a, Transcriptional repressor p66 alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gatad2aQ8CHY6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gatad2aQ8CHY6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gatad2aQ8CHY6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gatad2aQ8CHY6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms