Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atad2Q8CDM1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atad2Q8CDM1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atad2Q8CDM1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms