Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6030452D12RikQ8CD33 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms