Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7M3

Trim9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim9Q8C7M3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim9Q8C7M3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim9Q8C7M3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim9Q8C7M3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms