Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol7cQ8C6E1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol7cQ8C6E1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms