Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccz1Q8C1Y8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccz1Q8C1Y8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccz1Q8C1Y8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms