Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rd3Q8BRE0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rd3Q8BRE0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms