Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
5730596B20RikQ8BQ08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms