Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbfox3Q8BIF2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbfox3Q8BIF2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms