Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bhlhe23Q8BGW3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bhlhe23Q8BGW3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bhlhe23Q8BGW3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms