Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Katnb1Q8BG40 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Katnb1Q8BG40 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms