Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc27Q80YS5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Lrrc27Q80YS5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc27Q80YS5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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