Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otop3Q80UF9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otop3Q80UF9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms