Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cep170bQ80U49 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cep170bQ80U49 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cep170bQ80U49 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cep170bQ80U49 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms