Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IfnkQ7TSL0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnkQ7TSL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms