Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dsg1cQ7TSF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms