Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ShprhQ7TPQ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ShprhQ7TPQ3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ShprhQ7TPQ3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ShprhQ7TPQ3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms