Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ScocQ78YZ6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScocQ78YZ6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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