Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfrkbQ6PIJ4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfrkbQ6PIJ4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfrkbQ6PIJ4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms