Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnip4Q6PHZ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms