Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dhx40Q6PE54 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dhx40Q6PE54 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dhx40Q6PE54 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms