Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Papd7Q6PB75 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Papd7Q6PB75 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Papd7Q6PB75 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms