Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cntn4Q69Z26 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cntn4Q69Z26 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cntn4Q69Z26 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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