Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Top2bQ64511 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Top2bQ64511 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Top2bQ64511 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms