Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ss18Q62280 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ss18Q62280 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ss18Q62280 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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