Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifna15Q61718 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ifna15Q61718 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms