Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms