Protein–RNA interactions for Protein: Q60778

Nfkbib, NF-kappa-B inhibitor beta, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbibQ60778 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbibQ60778 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfkbibQ60778 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbibQ60778 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms