Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NotoQ5TIS6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NotoQ5TIS6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.6 ms