Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CluhQ5SW19 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CluhQ5SW19 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms