Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAT1Q5SQI0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms