Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trdv4Q5R1A3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv4Q5R1A3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 545.7 ms