Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Trim41Q5NCC3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Trim41Q5NCC3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Trim41Q5NCC3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms